Wektorowe bazy danych oparte na grafach wykorzystują struktury grafów do reprezentowania i przechowywania wektorów. Węzły lub krawędzie w grafie są powiązane z reprezentacjami wektorów. Można wykonywać wyszukiwanie podobieństw i operacje przechodzenia przy użyciu algorytmów grafowych, takich jak wyszukiwanie najbliższego sąsiada, spersonalizowany PageRank lub grupowanie grafów.
Podczas gdy bazy danych grafów doskonale radzą sobie z przechwytywaniem relacji, niektóre relacje mogą nie mieć nieodłącznego znaczenia lub znaczenia w pewnych kontekstach. Relacje ustanowione między węzłami w tego typu bazach danych mogą opierać się na arbitralnych połączeniach lub skojarzeniach. Może to oznaczać, że nie wszystkie relacje w grafowej bazie danych muszą mieć sensowną interpretację.
Do użytkownika należy odpowiednie ustrukturyzowanie i zaprojektowanie, aby zachować funkcjonalne relacje. Ułatwia to przeszukiwanie bazy danych w celu uzyskania lepszego wglądu w te relacje.